O que este site é
Treze calculadoras publicadas se distribuem em nove categorias: diluição e concentração, biologia molecular, DNA e RNA, proteína, cultura celular, conversão de unidades, prática de laboratório, planejamento experimental e dados de referência. Ao lado delas há três espaços de trabalho em vez de cálculos isolados: um planejador de placas de 96 poços, um registro de inventário de reagentes e um conjunto de tabelas de referência cujos valores nomeiam suas fontes.
Tudo é gratuito, nada fica atrás de um login, e nenhuma ferramenta está marcada como prévia ou como espaço reservado. O site é um conjunto de páginas servidas ao seu navegador; não há um servidor que o modele.
Por que ele existe
Grande parte dessa aritmética é conhecida. Uma técnica que passou um ano fazendo diluições seriadas não precisa que lhe digam o que C₁V₁ = C₂V₂ diz. O que cansa, e o que dá errado às quatro da tarde com um tubo na mão, é redervar tudo cada vez: o fator que deveria ter sido invertido, a unidade que mudou sem avisar, o volume que estava bom no papel e é impossível num poço.
O BiomeBench existe para tornar essa camada chata. Ele não tenta substituir o julgamento sobre um experimento; tenta remover a pequena incerteza aritmética que está embaixo dele.
Métodos na superfície, não escondidos
Cada calculadora declara a relação que aplica, as suposições de que parte e os limites da sua própria validade, na mesma página do seu resultado. Cada ferramenta tem um painel para isso. A literatura de onde uma fórmula foi tirada é citada, e não apenas sugerida, e as unidades são mostradas, e não presumidas, porque um número cuja unidade é invisível é um número que ninguém consegue conferir.
Isso é uma posição de projeto, não uma cortesia. Uma ferramenta que não mostra o seu método pede que você confie nela, e confiança é a ferramenta errada na bancada.
Como a aritmética é conferida
Além dos testes comuns, o projeto mantém duas suítes de verificação que recalculam desde primeiros princípios as saídas das calculadoras e as alocações na placa — por uma rota numérica deliberadamente diferente, já que o mesmo erro de transcrição não pode pegar a si mesmo — e comparam as duas sob uma tolerância declarada. Essas suítes são impedidas, pela própria auditoria de fontes, de importar o código que conferem.
Diga com clareza o que isso estabelece e o que não estabelece. Isso estabelece que duas implementações independentes de um modelo documentado concordam dentro de uma tolerância. Não estabelece que o modelo seja correto para o seu ensaio, e não é uma validação feita por alguém de fora do projeto.
O seu trabalho fica na sua máquina
As entradas são processadas no navegador e não são enviadas a lugar nenhum. O trabalho que você escolher salvar — um layout, uma entrada de inventário, um resultado capturado — é escrito no armazenamento local do seu próprio navegador, sob chaves que começam com biomebench-, e pode ser excluído ali. O site não define cookies e não carrega script de análise ou de publicidade.
Isso é uma consequência da arquitetura mais do que uma promessa: sem conta e sem banco de dados, não há lugar onde dados experimentais possam se acumular.
O que o BiomeBench não alega
Não é um sistema de gerenciamento de informações de laboratório, não guarda um instrumento, não pede um reagente e não passa a ser um sistema de registro. Não oferece orientação clínica, diagnóstica ou terapêutica. Não é monetizado por assinaturas, e não se posiciona contra as grandes suítes comerciais que um laboratório já utilize.
Ele não publica certificação, acreditação ou endosso nenhum, e não afirma que exista uma pessoa jurídica por trás do site. Onde o projeto não consegue responder a algo a partir do próprio código, as páginas daqui dizem isso em vez de supor.
Onde isso cabe num dia de bancada
Um cálculo responde a uma pergunta. Um resultado pode ser incorporado ao experimento em que você está trabalhando e reutilizado como entrada em outro lugar, de modo que uma diluição já resolvida não precisa ser redigitada num layout de placa. O planejador transforma isso em poços, confere o layout quanto a volume e a consistência espacial, e exporta um registro portátil. O inventário responde, na manhã seguinte, à pergunta sobre se o reagente ainda está em estoque.
O trabalho com placas é hoje de 96 poços: linhas A até H, colunas 1 até 12. Outras geometrias de placa não são suportadas, em vez de serem suportadas mal.