Häufig gestellte Fragen

BiomeBench ist eine Sammlung von Web-Rechen- und Planungstools für Biologie und Laborwissenschaften: dreizehn veröffentlichte Rechner für Verdünnungen, Molarität, Zellkultur, PCR, absorptionsbasierte Konzentration, Plattierungszellzahlen und Einheitenumrechnung, plus ein 96-Well-Plattenplaner, ein Reagenzien-Inventarbuch und ein Satz zitierter Referenztabellen.

Es ist für Menschen geschrieben, die am Labortisch arbeiten oder die Arbeit dafür planen: Forschende, Laboranten, Studierende im Master und im Bachelor sowie Dozierende, die Lehrlabore vorbereiten. Jeder Rechner gibt die von ihm verwendete Beziehung an, damit Nutzer sie gegen ihr eigenes Protokoll prüfen können.

Die Berechnungen fallen in neun Kategorien: Verdünnung und Konzentration, Molekularbiologie, DNA/RNA, Protein, Zellkultur, Einheitenumrechnung, Laborpraxis, Versuchsplanung und Referenzdaten. Planer und Inventar sind Arbeitsbereiche statt einzelner Berechnungen: Sie halten ein Plattenlayout und ein Lagerbuch im Browser, während Sie arbeiten.

Ja. Jedes Tool auf BiomeBench ist kostenlos, ohne kostenpflichtige Variante, ohne Nutzungskontingent und ohne dass für den Zugriff auf eine Berechnung ein Konto nötig wäre.

Nein. BiomeBench hat keine Registrierung, keinen Login und keinerlei Nutzerkonten. Es gibt nichts zu registrieren, und keine Identität wird benötigt, um ein Tool zu nutzen oder dahin zurückzukehren.

Ihre Recheneingaben werden in Ihrem Browser verarbeitet und nicht an einen BiomeBench-Server übertragen. Die Website setzt keine Cookies. Arbeit, die Sie bewusst speichern — ein Plattenlayout, Inventareinträge, gespeicherte Ansätze, erfasste Ergebnisse — wird in den lokalen Speicher Ihres eigenen Browsers unter Schlüsseln namens biomebench-* geschrieben, die Theme-Einstellung unter bb-theme.

Löschen Sie die Websitedaten für biomebench.com in den Browser-Einstellungen, oder löschen Sie einzelne Einträge direkt in Planer und Inventar. Da die Daten nur auf Ihrem Gerät liegen, ist mit dem Löschen dort alles vollständig entfernt; es gibt keine serverseitige Kopie, die wir auf Anfrage löschen könnten.

Derzeit wird auf keiner Seite ein Drittanbieter-Analytics- oder Werbeskript geladen. Die Website enthält einen kleinen internen Ereignisbus, an den später ein Anbieter angedockt werden könnte; er beschränkt sich auf zwei Ereignisnamen und eine Tool-Kennung und enthält nie einen von Ihnen eingegebenen Wert. BiomeBench setzt keine Cookies. Anfragen zum Laden der Schriften der Website erreichen Googles Schriftserver, und Hosting-Anfragelogs auf Infrastrukturebene liegen außerhalb der Kontrolle dieser Anwendung. Siehe die Datenschutzbestimmungen für die vollständigen Informationen.

Jeder Rechner implementiert eine angegebene Beziehung statt eines undurchsichtigen Modells, und die Methode, ihre Annahmen und ihre Grenzen werden auf der Tool-Seite angezeigt, damit Sie prüfen können, ob sie zu Ihrem Protokoll passt. Über Unit-Tests hinaus pflegt das Projekt zwei Verifikationssuiten, die die Ausgaben der Rechner und die Plattenzuteilungen auf einem bewusst unabhängigen numerischen Weg aus ersten Grundsätzen neu berechnen und beide unter einer expliziten Toleranz vergleichen. Übereinstimmung auf dieser Ebene ist ein ingenieurtechnischer Gegencheck, keine Behauptung, dass eine Zahl für Ihren Assay korrekt ist.

Betrachten Sie ein Ergebnis als arithmetische Folge Ihrer Eingaben. Prüfen Sie die Antwort, bevor Sie Reagenzien oder eine Probe einsetzen, gegen Ihr Protokoll, die Einstellungen Ihres Geräts und die Reagenzien, die tatsächlich vor Ihnen liegen, und beachten Sie die Rundung, die jedes Feld anwendet.

Nein. BiomeBench ist für Forschungs- und Lehrzwecke. Es liefert keine klinische, diagnostische, therapeutische oder regulatorische Anleitung, und keine Ausgabe sollte als alleinige Grundlage einer Entscheidung verwendet werden, die Patientenversorgung, Lebensmittelsicherheit oder Freisetzung in die Umwelt betrifft.

Ja, dafür ist der Planer da: eine 96-Well-Platte über Proben, Bedingungen, Kontrollen und Replikaten legen, Konsistenzprüfungen gegen dieses Layout laufen lassen und eine portable Aufzeichnung davon exportieren. Wenn Ihr Labor mit einem Workflow für validierte Dokumente arbeitet, bewahren Sie die exportierte Aufzeichnung neben Ihrem eigenen Laborbuch auf, statt BiomeBench als Ihr führendes System der Aufzeichnung zu behandeln.

Volumen in Litern, Millilitern und Mikrolitern; Konzentration in Molar und dessen Teilmultiplen sowie Formen als Masse pro Volumen; Zellzahlen pro Milliliter und pro Well; Masse in Gramm, Milligramm und Mikrogramm; Temperatur in Celsius und Fahrenheit; und Zeit von Sekunden bis Tagen. Wenn ein Feld mehr als eine Einheit akzeptiert, werden die verfügbaren Optionen neben dem Feld angezeigt.

Ja. Der Planer arbeitet auf dem kanonischen 96-Well-Raster (Zeilen A–H, Spalten 1–12), unterstützt das Füllen ganzer Zeilen, ganzer Spalten und rechteckiger Bereiche für wiederholte Muster, meldet Volumen- und räumliche Konsistenzprobleme beim Aufbau eines Layouts und exportiert das Ergebnis. Ein dedizierter Normalisierungsrechner für Platten kümmert sich um die Ansaatdichte über die gesamte Platte.

Ein Rechner beantwortet eine Frage und bleibt zustandslos. Die Workflow-Tools halten die Form eines Experiments: Ein Berechnungsergebnis kann in den aktuellen Experimentkontext aufgenommen und anderweitig als Eingabe wiederverwendet werden, sodass eine bereits ermittelte Verdünnung nicht erneut ins Plattenlayout eingetippt werden muss. Das Inventar schließt den Kreis, indem es nachverfolgt, ob die vom Plan angenommenen Reagenzien tatsächlich im Lager sind.

Melden Sie es. Der nützlichste Bericht nennt das Tool, gibt die genauen Eingaben und Einheiten an, die Sie eingegeben haben, nennt die erhaltene Ausgabe und den erwarteten Wert samt der Rechnung dahinter. Die Kontaktseite hat dafür eine Vorlage. Vermutete Berechnungsfehler werden als zu behebende Defekte behandelt, nicht als Nutzerfehler.