Foire aux questions

BiomeBench est une collection d'outils web de calcul et de planification pour la biologie et les sciences de laboratoire : treize calculateurs publiés couvrant les dilutions, la molarité, la culture cellulaire, la PCR, la concentration par absorbance, les dénombrements sur plaque et la conversion d'unités, auxquels s'ajoutent un planificateur de plaque 96 puits, un registre d'inventaire de réactifs et un ensemble de tables de référence citées.

Il est écrit pour les personnes qui travaillent à la paillasse ou planifient le travail d'une paillasse : chercheurs, techniciens de laboratoire, étudiants de master et de licence, et enseignants préparant des travaux pratiques. Chaque calculateur énonce la relation qu'il utilise, afin que l'utilisateur puisse la vérifier contre son propre protocole.

Les calculs se répartissent en neuf catégories : dilution et concentration, biologie moléculaire, ADN/ARN, protéines, culture cellulaire, conversion d'unités, pratique du laboratoire, planification expérimentale et données de référence. Le planificateur et l'inventaire sont des espaces de travail plutôt que de simples calculs : ils conservent une disposition de plaque et un registre de stock dans votre navigateur pendant que vous travaillez.

Oui. Tous les outils de BiomeBench sont gratuits, sans offre payante, sans quota d'utilisation et sans compte requis pour accéder à un calcul.

Non. BiomeBench n'a ni inscription, ni connexion, ni aucun type de compte utilisateur. Il n'y a rien à enregistrer, et aucune identité n'est nécessaire pour utiliser un outil ou y revenir.

Vos saisies de calcul sont traitées dans votre navigateur et ne sont pas transmises à un serveur BiomeBench. Le site ne dépose pas de cookies. Le travail que vous enregistrez volontairement — une disposition de plaque, des entrées d'inventaire, des préparations enregistrées, des résultats capturés — est écrit dans le stockage local de votre propre navigateur sous des clés nommées biomebench-*, et le thème sous bb-theme.

Effacez les données de site pour biomebench.com dans les réglages de votre navigateur, ou supprimez des entrées individuelles depuis le planificateur et l'inventaire. Comme les données ne résident que sur votre appareil, les supprimer là les supprime entièrement ; il n'existe aucune copie côté serveur que nous puissions supprimer sur demande.

Aucun script tiers d'analytics ou de publicité n'est chargé sur aucune page à ce jour. Le site embarque un petit bus d'événements interne auquel un fournisseur pourrait plus tard être branché ; il se limite à deux noms d'événements et à un identifiant d'outil, et n'inclut jamais une valeur que vous avez saisie. BiomeBench ne dépose pas de cookies. Les requêtes de chargement des polices du site parviennent bien aux serveurs de polices de Google, et les journaux de requêtes d'hébergement au niveau de l'infrastructure échappent au contrôle de cette application. Consultez la page Politique de confidentialité pour le tableau complet.

Chaque calculateur met en œuvre une relation énoncée plutôt qu'un modèle opaque, et la méthode, ses hypothèses et ses limites sont affichées sur la page de l'outil afin que vous puissiez confirmer qu'elles correspondent à votre protocole. Au-delà des tests unitaires, le projet maintient deux suites de vérification qui recalculent les sorties des calculateurs et les allocations de plaque à partir des premiers principes par une voie numérique délibérément indépendante et comparent les deux sous une tolérance explicite. Cette concordance est un contrôle croisé d'ingénierie, pas une affirmation qu'un nombre est correct pour votre dosage.

Considérez un résultat comme la conséquence arithmétique des saisies que vous avez fournies. Avant d'engager des réactifs ou un échantillon, vérifiez la réponse contre votre protocole, les réglages de votre instrument et les réactifs réellement devant vous, et notez l'arrondi appliqué par chaque champ.

Non. BiomeBench est destiné à la recherche et à l'enseignement. Il ne fournit pas de conseils cliniques, diagnostiques, thérapeutiques ou réglementaires, et aucune sortie ne doit être utilisée comme seule base d'une décision affectant les soins aux patients, la sécurité alimentaire ou le rejet dans l'environnement.

Oui, et c'est le rôle du planificateur : disposer une plaque 96 puits entre échantillons, conditions, contrôles et répétitions, exécuter des contrôles de cohérence sur cette disposition et exporter un enregistrement portable. Si votre laboratoire fonctionne sous un flux de documents validés, conservez l'enregistrement exporté à côté de votre propre cahier de laboratoire plutôt que de traiter BiomeBench comme votre système d'enregistrement de référence.

Le volume en litres, millilitres et microlitres ; la concentration en molaire et ses sous-multiples plus les formes masse par volume ; les comptages cellulaires par millilitre et par puits ; la masse en grammes, milligrammes et microgrammes ; la température en Celsius et Fahrenheit ; et le temps de la seconde au jour. Quand un champ accepte plus d'une unité, les options disponibles sont affichées à côté du champ.

Oui. Le planificateur fonctionne sur la grille canonique 96 puits (lignes A–H, colonnes 1–12), prend en charge le remplissage de lignes entières, de colonnes entières et de plages rectangulaires pour des motifs répétés, signale les problèmes de volume et de cohérence spatiale pendant que vous construisez une disposition, et exporte le résultat. Un calculateur dédié de normalisation de plaque gère la densité d'ensemencement sur toute la plaque.

Un calculateur répond à une question et reste sans état. Les outils de workflow portent la forme d'une expérience : un résultat de calcul peut être capturé dans le contexte de l'expérience en cours et réutilisé comme saisie ailleurs, de sorte qu'une dilution déjà calculée n'a pas à être ressaisie dans la disposition de plaque. L'inventaire referme la boucle en suivant si les réactifs que le plan suppose sont réellement en stock.

Signalez-le nous. Le signalement le plus utile nomme l'outil, donne les saisies et unités exactes que vous avez entrées, énonce la sortie reçue et la valeur attendue avec le calcul derrière. La page Contact propose un modèle pour cela. Les erreurs de calcul suspectées sont traitées comme des défauts à corriger, pas comme des erreurs de l'utilisateur.