よくある質問

BiomeBenchは、生物学と実験科学のための計算・計画ウェブツールの集まりです：希釈、モル濃度、細胞培養、PCR、吸光度に基づく濃度、播種細胞数、単位変換を扱う13の公開計算ツールに加え、96ウェルプレートプランナー、試薬在庫台帳、出典付き参考テーブル集を含みます。

ベンチワークに従事する方、またはその作業を計画する方のために書かれています：研究者、実験技術者、大学院生・学部生、教育用の実習を準備する教官。すべての計算ツールは用いている関係式を明示するので、自分のプロトコルと照らし合わせて確認できます。

計算は9つのカテゴリに分かれます：希釈と濃度、分子生物学、DNA/RNA、タンパク質、細胞培養、単位変換、実験室実務、実験計画、参考データ。プランナーと在庫機能は単発の計算ではなくワークスペースです：作業中、プレートレイアウトと在庫台帳をブラウザ内に保持します。

はい。BiomeBenchのすべてのツールは無料で、有料プランも使用量制限もなく、どの計算を使うにもアカウントは不要です。

いいえ。BiomeBenchにはサインアップ、ログイン、いかなる種類のユーザーアカウントもありません。登録する必要はなく、ツールを使うにも戻ってくるにも身元は必要ありません。

計算への入力はあなたのブラウザ内で処理され、BiomeBenchのサーバーに送信されることはありません。当サイトはCookieを設定しません。あなたが意図的に保存する作業 — プランナーのレイアウト、在庫エントリ、保存した調液、取り込んだ結果 — は、あなたのブラウザのローカルストレージに biomebench-* という名前のキーで書き込まれ、テーマ設定は bb-theme に保存されます。

ブラウザの設定で biomebench.com のサイトデータを消去するか、プランナーおよび在庫機能内で個々のエントリを削除してください。データはお使いのデバイスにのみ存在するため、そこで削除すれば完全に消えます。削除依頼に応じてこちらが消せるサーバー側のコピーはありません。

現在、どのページにもサードパーティのアナリティクスや広告のスクリプトは読み込まれていません。当サイトは小さな内部イベントバスを備えており、将来プロバイダーが接続される可能性があります。ただし2つのイベント名とツール識別子に限定され、あなたが入力した値は含まれません。BiomeBenchはCookieを設定しません。フォント読み込みのリクエストはGoogleのフォントサーバーに届きますが、インフラ層におけるホスティングのリクエストログは本アプリケーションの制御外です。全体像はプライバシーポリシーのページをご覧ください。

各計算ツールは、不透明なモデルではなく明示された関係式を実装しており、手法・その前提・限界はツールページに表示されるため、自分のプロトコルと一致することを確認できます。ユニットテストに加え、本プロジェクトは2つの検証スイートを維持しています。これらは計算出力とプレートへの配分を、意図的に独立した数値経路で第一原理から再計算し、明示的な許容誤差の下で両者を比較します。そのレベルでの一致は工学的なクロスチェックであり、ある数があなたのアッセイで正しいという主張ではありません。

結果は、あなたが入力した値の算術的な帰結として扱ってください。試薬や検体に費やす前に、答えを自身のプロトコル、機器の設定、目の前にある実際の試薬と照らし合わせ、各フィールドに適用される丸めに注意してください。

いいえ。BiomeBenchは研究および教育目的のためのものです。臨床・診断・治療・規制に関する助言は提供せず、患者ケア、食品安全、環境放出に関わる判断の唯一の根拠として出力を用いるべきではありません。

はい、まさにプランナーの目的はそれです：96ウェルプレートに検体・条件・対照・反復を配置し、そのレイアウトに対して整合性チェックを行い、ポータブルな記録としてエクスポートします。あなたのラボが検証済み文書のワークフローで運用されている場合は、エクスポートした記録を自身のノートと合わせて保管し、BiomeBenchを公式の記録システムとして扱わないでください。

容量はリットル・ミリリットル・マイクロリットル、濃度はモラーとそのサブユニットおよび質量/体積の形、細胞数はミリリットル当たり・ウェル当たり、質量はグラム・ミリグラム・マイクログラム、温度はセルシウス度・ファーレンハイト度、時間は秒から日までです。1つのフィールドが複数の単位を受け付ける場合、利用可能な選択肢はフィールドの横に表示されます。

はい。プランナーは標準的な96ウェルのグリッド（行 A–H、列 1–12）で動作し、繰り返しパターンに対して行全体・列全体・矩形範囲の塗りつぶしに対応し、レイアウト作成中に容量や空間整合性の問題を警告し、結果をエクスポートします。プレート正規化専用の計算ツールが、プレート全体の播種密度を扱います。

計算ツールは1つの問いに答えるだけで、状態を保持しません。ワークフローツールは実験の全体像を保持します：計算結果を現在のエクスペリメントのコンテキストに取り込み、他の場所での入力として再利用できるため、すでに求めた希釈をプレートレイアウトに再入力する必要がありません。在庫機能は、計画が前提とする試薬が実際にあるか追跡することでループを閉じます。

お知らせください。最も有用な報告は、ツール名を特定し、入力した正確な値と単位を示し、受け取った出力を記載し、期待した値とその背後にある計算を記述するものです。お問い合わせページにテンプレートがあります。計算誤りの疑いは、ユーザーエラーではなく修正すべき欠陥として扱われます。